1995年4月，国家中医药管理局、卫生部、国家工商局共同制订并下发了《整顿中药材专业市场标准》，全国整顿中药材专业市场工作逐步展开。全国原有的117个药品集贸市场和药材市场，至1997年，先后有17个中药材专业市场通过验收，90个市场被关闭、取缔或转营他业，同时，各地从维护国家社会经济秩序稳定、保证人民群众健康的大局出发，关闭取缔了一批未经批准的药材市场和药品集贸市场。从而有效地规范了我国药材流通秩序，保障了人民群众用药安全。自1997年审批通过17家药材市场后，再没有审批新的药材市场。
其中安徽亳州中药材市场、河北安国中药材市场、河南禹州中药材市场、江西樟树中药材市场这4家，都有着悠久的历史，被称为“四大药都”。
安徽亳州中药材市场
河北安国中药材市场
河南禹州中药材市场
江西樟树中药材市场
2013 年11 月24 日开业的亳州中药材专业市场源自1995年建成的中国亳州中药材交易中心，20多年来，作为全国规模最大的中药材交易中心，始终保持中药材专业市场的龙头地位。目前，亳州中药材专业市场年销售额已经突破400亿元。
1984年，工商部门对药材交易资源进行整合，在当时的东关附近设立了药材贸易市场，即现在的工业批发市场，并在其东面开辟了药材一条街，全部采取前店后仓形式建造。
1995年，亳州建成当时国内规模最大、功能完善、设施齐全、档次最高的中国亳州中药材交易中心，大药行搬迁到火车站附近，并于1996年开始正式营业，成就了亳州国家级专业交易市场。
2010年4月，康美药业股份有限公司正式进驻亳州中药材专业市场。接手后，该公司首先规范市场摊位的陈列摆设，引导药商经营习惯，提升药商经营理念；并在市场内部推行“统一标价签、统一工服工牌、统一药材包装”三统一管理，为中药材规范化的分区分类五统一管理奠定基础。同时，通过加大市场日常巡查、定期抽查力度，评选月度、季度、年度诚信经营之星，使市场诚信经营蔚然成风，市场面貌焕然一新，知名度、美誉度显著提升。
2010年，投资30亿元的康美（亳州）华佗国际中药城项目奠基，这也是亳州中药材专业市场当前的所在地。该项目总占地1000亩，建筑面积122.1万平方米，采用两轴两心布局，分布着药材交易中心、精品药材步行街、配套商业中心、单元式药材交易市场、饮片营销展示中心、会展酒店研发中心综合体、香料城、大型现代物流仓储区。
1991年，安国撤县建市。沐浴着改革开放的春风，安国药业经济发展掀开了新的一页。“药都”安国市古称祁州，是全国最大的中药材集散地，素有“草到安国方成药、药经祁州始生香”的美誉。1994年，安国东方药城建成，总投资8亿元，位于安国市区东北部。是国家认定的17家中药材专业市场之一，它占地1.5平方公里，建筑面积60万平方米，分上下两层。其规模是全国之最。内有商楼一千一百多座，中药材经营企业一千三百多家，其中有来自北京、天津、上海、内蒙、西藏等全国各地的医药经销企业八十多家。
中心交易大厅是东方药城集中交易场所之一，占地15亩，经营面积12000多平方米，有固定商位4000多个。东方药城年成交额超过60亿元，年药材吞吐量10万吨，日交易客商超过1万人。中药材年交易额超过60亿元。
2017年5月23日，安国数字中药都一期工程竣工并鸣锣开市，此次安国数字中药都中央交易大厅试运营，标志着安国中药产业转型升级迈出了新步伐。
素有“中华药城”之称的河南禹州，也是我国医药发祥地之一。禹州具有悠久的中药材种植、采集、加工历史，以加工精良、遵古炮制著称于世。历史上就有“药不到禹州不香，医不见药王不妙”之说。自春秋战国以来，神医扁鹊、医圣张仲景、药王孙思邈等都曾在禹行医采药、著书立说。在他们的直接影响下，禹州的医药业也得到大的发展，从唐朝开始禹州的药市逐步形成，伴随着药业的进一步发展和繁荣，明朝时期，禹州就成为全国四大药材集散地之一。
1996年，禹州被国家中医药管理局、卫生部、国家工商行政管理局定为全国十七个中药材专业市场，河南省唯一的国家定点药材专业市场。2001年，禹州市投资两亿元人民币新建了现今的河南禹州中药材专业市场(又称中华药城)。目前该市场是中国十七家标准化、规范化的国家级中药材专业市场之一，也是河南唯一的国家级定点中药材专业市场。药城占地面积四百余亩，包括建筑面积两万三千平方米、可容纳两千五百个摊位的中心交易大厅，以及两千余间三层以上经商楼，并附属仓储、银行、饭店、停车场、娱乐场等各种服务设施，是一所集物流、信息、金融等为一体的大型现代化中药材专业市场。市场经营品种上千种，固定从业人员上万人，年交易额达十亿元人民币。
目前，禹州中药材市场拥有全国各地药商六百多家。同时，在市场周边聚集着许多内地知名中成药厂家，市场经营的中药材品种达上千种，以批发为主，兼顾零售，主要是现金交易。
江西省樟树市在唐朝即辟为药墟，宋元时形成药市，明清时期臻于鼎盛，终成“南北川广药材之总汇”的大气候。但由于设施落后，交易方式陈旧等原因，近年来，“药都”繁华逐渐逝去。
2004以来，樟树开始规划建设一个档次高、规模大、硬件设施的中药材专业市场。市场规划面积为５００亩，建筑总面积达２５万平方米，拥有集商贸、仓储、居家为一体的店铺１０００余套，设有功能齐全的现代化电子商务交易大厅，以及休闲广场、阳光草坪、景观大道等配套设施。
新中药材专业市场一期规划紧邻１０５国道，长５００米，纵深３１１米，占地２３５亩，市场主入口处设置一个直径为１２０米的半圆形广场，建筑围绕广场展开，铺面房由３层半联排式单元组成，市场中央设置综合服务大厅，后侧布局停车、货物配载中心。一期市场总建筑面积１８万平方米，其中店面４万平方米，交易大厅０．６万平方米，仓储５万平方米，计划投资１．５亿元，可同时容纳１０００户以上药商入市经营。二期市场规划用地２５６亩，用于中药材加工、仓储、中转。
现有１６个省（市）、７２个县（市）的３００余户药商在场内经营，年成交量１０万吨，交易额超１０亿元，辐射全国２１个省（市）、港、澳、台以及东南亚地区。
