2016中国大学本科毕业生质量仍然只设两项指标：教师平均学术水平在全国大学中的名次；新生录取分数线在全国大学中的名次。
本科毕业生质量排名的计算过程：将每所大学的教师平均学术水平在全国大学中的名次，与新生录取分数线在全国大学中的名次相加并除以2，得到毕业生得分（越小越好），将所有大学的毕业生得分按升序排列，即得到全国大学本科毕业生质量排行榜。毕业生得分相同的，教师学术水平高的大学排在前面。
注：2016中国大学各项指标等级评价方法
2016中国大学各项指标等级评价采用百分比法，用A、B、C、D、E共5等11级表示各大学的实力。各等级定义如下：
A等：前10%为A等；其中实力最强的前2%是A++级，介于2%～5%（含，以下同）之间的是A+级，5%~10%为A级。
B等：介于10%～30%之间为B等，占20%；其中 10%~20%为B+级，20%~30%为B级。
C等：介于30%～50%之间为C等，占20%；其中 30%~40%为C+级，40%~50%为C级。
D等：介于50%～70%之间为D等，占20%；其中50%~60%为D+级，60%~70%为D级。
E等：最后的30%为E等；其中70%～85%为E+级，85%~100%为E级。
本排行榜中，本科毕业生质量、教师平均学术水平、新生质量等级在C级及以上的，列出排名和等级，C级以下的只列等级，不列排名。
