2013年11月，《2013全国名医院排行榜》最新版公布，最新榜单以2012年全国名医院排行榜为基础，综合近一年各医院综合实力，重新排名，与2012年《全国名医院排行榜》榜单相比，不少医院依然榜上有名，也不乏新晋榜单医院。
榜单显示，全国最好医院综合排名中，武汉同济医院由去年的第10位上升到第9位，广东省人民医院下降1位；最好的神经内科医院，北京协和医院被挤出前5名；全国最好的神经外科医院中，北京天坛医院依旧稳居榜首；最好的心血管专科医院中，上海远大心胸医院入榜排名第5位；16个榜单中，北京协和医院占据其中10个榜单，综合实力最强。
《2013年全国名医院排行榜》仍为16个榜单，依次为：
1.全国最好医院综合排名；
2.全国最好的神经内科医院；
3.全国最好的神经外科医院；
4.全国最好的肿瘤科医院；
5.全国最好的心血管病专科医院；
6.全国最好的耳鼻喉科医院；
7.全国最好的眼科医院；
8.全国最好的骨科医院；
9.全国最好的妇产科医院；
10.全国最好的烧伤科医院；
11.全国最好的口腔科医院；
12.全国最好的消化内科医院；
13.全国最好的呼吸内科医院；
14.全国最好的内分泌科医院；
15.全国最好的儿科医院；
16.全国最好的肝病医院。
附：各榜单上榜医院及排名
